Plus récemment c'est à travers un projet de maîtrise en bioinformatique initié en 2005, que j'ai eu l'occasion de mettre en pratique le modèle du web sémantique. Le site Bio2RDF.org est un projet d'intégration de données scientifiques dans le domaine de la génomique qui a obtenu une importante visibilité car il a répondu dès 2007 à un besoin réel de la communauté scientifique : illustrer comment le web sémantique et ses technologies RDF et SPARQL peuvent être utiles. L'objectif du projet en soi était simple, il s'agissait de convertir des dizaines de bases de données publiques au format RDF, d'où le nom du projet : base de données BIOlogiques, converties (2) au format RDF. Les quatre règles de base des données en réseau (linked data) énoncées par Tim Berner Lee ont systématiquement été mise en pratique. Ce fût un des éléments clé du succès de ce projet. En tout, C'est 42 bases de données qui ont été ainsi converties et mises à la disposition des scientifiques sous la forme d'un point de service SPARQL. La technologie Virtuoso, un triplestore sous licence GPL a ainsi servi à publier plus de 2 milliards de triplets provenant de domaines aussi diversifiés que la structure 3D des protéines, les maladies génétiques et la littérature scientifique bio-médicale. En 2009, à l'occasion d'un premier recensement de la planète RDF, le projet Bio2RDF représentait 40 % des triplets disponibles, il s'agit de la partie rose au bas de la carte. Ce projet est hébergé ici à Québec, sur le boulevard Laurier.
Avec la montée en force du web sémantique depuis la dernière année, illustrée par son adoption par les gouvernements Anglais et Américain, j'espère humblement pouvoir faire profiter les internautes de mon expérience du web sémantique en partageant avec eux mes découvertes et mes réflexions dans ce domaine porteur d'avenir et de liberté, celui des données ouvertes disponibles sur la toile (open data) et libre d'y circuler sans contrainte.
Avec la montée en force du web sémantique depuis la dernière année, illustrée par son adoption par les gouvernements Anglais et Américain, j'espère humblement pouvoir faire profiter les internautes de mon expérience du web sémantique en partageant avec eux mes découvertes et mes réflexions dans ce domaine porteur d'avenir et de liberté, celui des données ouvertes disponibles sur la toile (open data) et libre d'y circuler sans contrainte.
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